Český ústavní soud rozhodl, že rodičům, kterým svědomí nedovoluje očkovat své dítě, hygienická stanice nesmí udělit pokutu. Dodnes bylo možné udělit takovou výjimku pouze v případě náboženského přesvědčení. Dle soudu není nutné, aby se přesvědčení zakládalo na objektivní pravdě nebo racionalitě, musí být ovšem prokázáno, že je naléhavé, konzistentní a jejich tvrzení jsou přesvědčivá. Musejí být také zhodnoceny společenské dopady, které může akceptovaná sekulární výhrada svědomí mít. Může jí být například prokazatelně špatná zkušenost s očkováním u starších sourozenců nebo rodinná anamnéza.